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Inra Val de Loire - UR Amélioration, génétique et physiologie forestières

Site de l'UR AGPF de l'INRA

Gilles PILATE (Directeur de Recherches - HDR)

Gilles PILATE
© uagpf
Directeur d'Unité - Physiologie de la formation du bois : identification et caractérisation des acteurs moléculaires responsables des propriétés du bois

Fonctions

Directeur de Recherches 1ère classe à l’Unité de Recherches Amélioration, Génétique et Physiologie Forestières, rattachée au département Écologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (EFPA)

Directeur de l’unité AGPF depuis le 1er Janvier 2009

Cursus

  • 1984. DEA de Biologie et Physiologie Végétales, Université Paris VI
  • 1985-1987. Thèse de l’Université Paris VI, Sciences de la Vie, Biologie et Physiologie végétales, Laboratoire d’Ontogenèse expérimentale, Université Paris VI, bourse MRT.
  • 2002. HDR Sciences de la Vie, CNU section 66, UFR Sciences, Université d’Orléans

Cursus professionnel

  • 1988. Stage post-doctoral, Molecular Genetic Lab, Biological Science Division, NRCC, Ottawa, Ontario, Canada, Summit Canadian fellowship.
  • 1989-1991. Research Associate, Conifer Biotechnology Lab, Plant Biotechnology Institute, NRCC, Saskatoon, Saskatchewan, Canada
  • 1991-présent. Chercheur INRA-AGPF

Sociétés savantes

  • 2009. Elu à l’ “International Academy of Wood Science”

Participation invitée à des congrès

  • 2015 Plant Biomech 8, Nagoya (Japon)
  • 2015 IUFRO Tree Biotech Florence (Italie)
  • 2015 Journées Condorcet “Agrosciences, environnement et développement durable”Compiègne

Thèmes de Recherche

  • Etude des déterminants moléculaires responsable des contraintes mises en place dans le bois de tension, qui permet aux arbres d’orienter leurs axes. Collaboration avec LMGC (CNRS-Montpellier) et ECOFOG (UMR Guyane), projet ANR Blanc Stress in Trees. Thèses de Fernanda Guedes (soutenue fin 2013) et de Amra Secerovic
  • Bois de tension et aptitude à la saccharification (projet FP7 EnergyPoplar, projet régional OPeNSPeNU
  • Valorisation des lignines actives chimiquement et aptitude à la saccharification : analyses sur peupliers GM à lignines modifiées menés en TCR. Collaboration avec le VIB à Ghent, projet FP7 EnergyPoplar, projet KBBE Tree4Joule.
  • Evaluation des nouvelles techniques d’édition du génome sur le peuplier (projet PIA Genius)

Encadrement

Thèses :

    • 2013-2016 Amra Šećerović, Université Orléans. Identification et caractérisation des acteurs moléculaires responsables des propriétés mécaniques du bois de tension chez des espèces avec ou sans couches G. Bourse de thèse INRA - Projet ANR Blanc StressInTrees, co-direction avec  Annabelle Déjardin
    • 2010-2013 Fernanda Guedes, Université Orléans. Recherche des molécules responsables des propriétés gélifiantes de la couche G du bois de tension de peuplier. Bourse CAPES (Coordination for the Improvement of Higher Level Personnel, Brazilian Ministry of Education).
    • 2007-2010 Régis Fichot, Université Orléans. Variabilité structurale et fonctionnelle du xylème et plasticité en réponse à la sécheresse chez le peuplier. Bourse MRT, co-direction avec Franck Brignolas (LBLGC, Université Orléans)
    • 2004-2007 Dominique Arnaud, Université Orléans.  Identification et caractérisation de la famille de protéines à domaine LIM chez le peuplier. Co-direction avec Daniel Locker, 324 p
    • 1999-2003 Florian Lafarguette, Université Orléans. Identification et caractérisation de gènes impliqués dans la formation du bois de tension chez le peuplier. Bourse région Centre, 181p
    • 1999-2002 Melinda Gatineau, Université Orléans. Vers une meilleure compréhension de l’absence de monomères de type syringyl dans les lignines de conifère : une approche par transformation génétique. Co-direction avec Marie-Anne Lelu, Bourse région Centre, 117p
    • 1993-1996 Valérie Levée, Université Orléans. Transformation via Agrobacterium tumefaciens du mélèze hybride (Larix x leptoeuropaea) et régénération de plants transgéniques. Co-direction avec Marie-Anne Lelu, Bourse région Centre/INRA, 120p
    • 1994-1997 Françoise Laurans, Université Orléans. Définition histologique et approche moléculaire des interactions peupliers/rouilles, Populus deltoides x P. nigra cv. 'Ogy' / Melampsora larici-populina races E1 et E2. Bourse MRT, 138p

Selected Publications

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Plomion C, Bastien C, Bogeat-Triboulot  M-B, Bouffier, Déjardin A, Duplessis S, Fady B, Heuertz M, Le Gac A-L, Le Provost G, Legué V, Lelu-Walter M-A, Leplé J-C, Maury S, Morel A, Oddou-Muratorio S, Pilate G, Sanchez L, Scotti I, Scotti-Saintagne C, Segura V, Trontin J-F, Vacher C, 2016. Forest tree genomics: 10 achievements from the past 10 years and future prospects. Annals of Forest Science 73: 77-103

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Leplé JC, Dauwe R, Morreel K, Storme V, Lapierre C, Pollet B, Naumann A, Kang KY, Kim H, Ruel K, Lefèbvre A, Joseleau JP, Grima-Pettenati J, De Rycke R, Andersson-Gunnerås S, Erban A, Fehrle I, Petit-Conil M, Kopka J, Polle A, Messens E, Sundberg B, Mansfield SD, Ralph J, Pilate G, Boerjan W, 2007. Downregulation of cinnamoyl-coenzyme A reductase in poplar: multiple-level phenotyping reveals effects on cell wall polymer metabolism and structure. Plant Cell 19: 3669-3691.

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Tuskan GA, DiFazio S, Jansson S, Bohlmann J, Grigoriev I, Hellsten U, Putnam N, Ralph S, Rombauts S, Salamov A, Schein J, Sterck L, Aerts A, Bhalerao RR, Bhalerao RP, Blaudez D, Boerjan W, Brun-Jacob A, Brunner A, Busov V, Campbell M, Carlson J, Chalot M, Chapman J, Chen GL, Cooper D, Coutinho P, Couturier J, Covert S, Cronk Q, Cunningham R, Davis J, Degroeve S, Dejardin A, de Pamphilis C, Detter J, Dirks B, Dubchak I, Duplessis S, Ehlting J, Ellis B, Gendler K, Goodstein D, Gribskov M, Grimwood J, Groover A, Gunter L, Hamberger B, Heinze B, Helariutta Y, Henrissat B, Holligan D, Holt R, Huang W, Islam-Faridi N, Jones S, Jones-Rhoades, M, Jorgensen R, Joshi C, Kangasjärvi J, Karlsson J, Kelleher C, Kirkpatrick R, Kirst M, Kohler A, Kalluri U, Larimer F, Leebens-Mack J, Leplé JC, Locascio P, Lou Y, Lucas S, Martin F, Montanini B, Napoli C, Nelson DR, Nelson CD, Nieminen K, Nilsson O, Pereda V, Peter G, Philippe R, Pilate G, Poliakov A, Razumovskaya J, Richardson P, Rinaldi C, Ritland K, Rouzé P, Ryaboy D, Schmutz J, Schrader J, Segerman B, Shin H, Siddiqui A, Sterky F, Terry A, Tsai CJ, Uberbacher E, Unneberg P, Vahala J, Wall K, Wessler S, Yang G, Yin T, Douglas C, Marra M, Sandberg G, Van de Peer Y, Rokhsar DS, 2006. The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray). Science 313: 1596-1604

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Pilate G, Guiney E, Holt K, Petit-Conil M, Lapierre C, Leplé JC, Pollet B, Mila I, Webster EA, Marstorp HG, Hopkins DW, Jouanin L, Boerjan W, Schuch W, Cornu D, Halpin C, 2002. Field and pulping performances of transgenic trees with altered lignification. Nat Biotechnol 20: 607-612

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